军机处是大清王朝中枢权力机关，于雍正七年（1729年）因用兵西北而设立。一度停止，乾隆时期又恢复，地方在隆宗门。隆宗门在乾清宫处前广场西则，门内北则就是军机处值房。军机处是暂时机构，不入编制，大多数人是兼职，不拿补贴，但其中人脉广泛，又接近朝廷中枢，亦是非常吃香。和绅担任领班时期，身兼军机大臣，打破了制衡的框架，要求“凡有奏折令具副本关会军机处”。如此以来，在制度设计上，就令军机处的地位大大提高，不仅参与决策，还实际掌控了信息渠道，皇帝被操纵的风险大大增加，这也是嘉庆走上帝位后极为关注的事情。
嘉庆在翦除和珅后，立即废除此条，特令灾难和军情急报要直接送他本人。此外，嘉庆帝还多次刻意地挫压朝臣中尊崇军机处的风气，并否决了一位官员提出的在奏折内将军机处抬写以示尊重的建议。嘉庆帝对于军机处的一连串打压，主要是基于对和珅专权的拨乱反正，由于和坤的问题，多数人情愿与其划清界线，也不愿对军机处说个好字，军机处被压制也是顺其自然了。不过皇帝他本人对于军机处的作用并不否定。
大举围剿镇压川、楚、陕农民起义时，他并没有多少经验，就是军机处作了严密军事部署，实行剿抚兼施的两手政策，分化瓦解起义军实行寨堡团练的坚壁清野政策，取得不错的成效。
不一会，嘉庆就到了军机处，里面烛光明亮，但空无一人。
虞公公知道事情搞大不堪收拾，连忙高声叫道：“来人哪，来人哪。”
一名年青人慌忙从旁边屋子跑过来跪下：“奴才叩见皇上，吾皇万岁，万岁，万万岁。”
嘉庆非常气愤，厉声喝问：“军机大臣呢？他们干什么去了。”
年青人伏在地上颤抖着不敢出声，恐怕是被吓着了。说实话，皇上从来没有半夜来过军机处，所以也就没有这个思想准备，今日突然皇上回到，不是说是小小的官员，就是一二品大员，也会受惊的。
“今儿是谁当值？快说。”嘉庆更加生气。
“启禀皇上，今日当值的是武郡王。”年青人已经浑身颤抖不已。
嘉庆四周看看，顿时有股气冲了出来：“武郡王？武郡王！他人呢？他人呢？”
“……这，这，禀报皇上，武……郡王已经回家歇着了。”年青人神色惊慌，伏在地上大气也不敢喘。。
嘉庆听罢，哈哈大笑起来并突然收敛。他知道，这些亲王都是自己的同族长辈，享受着优厚的俸䘵，占着重要位子，平日里吃喝拿要，好生快活，想不到关键时刻却不能替他分忧，真是可恨可悲。想到这，他禁不住发出悲叹：“好啊，好啊，都回家歇着吧！都走吧！这大清江山都是朕一个人的！太好了，好！堂堂的军机处竟然给朕唱的是一出空城计，朕到要看看这戏如何唱下去。”
虞公公见皇帝发火，异常惊怕，但还是尽量想法平息皇上的怒气：“皇上息怒，武郡王一向做事严谨，今日回家恐怕也是事出有因吧。说不定回家处理完事情，很快就会回来的。”
虞公公转过身对年青人说：“你快去把军机处的其它大臣叫回来。”
年轻人犹豫着，因为其它人也睡觉去了。他刚要退出去，嘉庆突然摆手：“慢。”
年轻人赶紧又趴下，浑身颤抖。
嘉庆看看地上的年青人，言语威严：“抬起头来，你是谁？”